Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SNAPC1Q16533 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
SNAPC1Q16533 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
SNAPC1Q16533 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.6 ms