Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SHPRHQ149N8 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 RNY4P10-201ENST00000365571 96 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-3.52□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SHPRHQ149N8 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
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SHPRHQ149N8 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-3.58□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 Y_RNA.79-201ENST00000362992 113 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 RNA5SP106-201ENST00000517274 100 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SHPRHQ149N8 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
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