RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: O14815
CAPN9, Calpain-9, human
Predictions only
Length
690 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CAPN9
O14815
AC069113.3-201
ENST00000521019
150 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MIR499B-201
ENST00000636498
73 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNU6-1051P-201
ENST00000365471
102 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNU6-675P-201
ENST00000384236
104 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
Y_RNA.558-201
ENST00000384685
113 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MIR1236-201
ENST00000408340
102 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNU4ATAC4P-201
ENST00000516307
126 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNU5B-6P-201
ENST00000516765
68 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
YWHAEP2-201
ENST00000580066
112 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MIR4796-201
ENST00000580742
81 nt
BASIC
0.25
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
Y_RNA.17-201
ENST00000362433
111 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
SNORA63.2-201
ENST00000362603
126 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
Y_RNA.125-201
ENST00000363371
111 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MIR519C-201
ENST00000385053
87 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
TRAJ61-201
ENST00000390479
60 nt
APPRIS P1
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MTATP6P29-201
ENST00000415057
132 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNU7-129P-201
ENST00000516128
62 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNA5SP170-201
ENST00000517150
101 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MIR5093-201
ENST00000583199
100 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MIR548AE1-201
ENST00000583292
70 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MIR548AD-201
ENST00000584780
82 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MIR6718-201
ENST00000616153
80 nt
BASIC
0.24
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
SNORA9.1-201
ENST00000362412
131 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNU6-1134P-201
ENST00000365156
101 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNU6-54P-201
ENST00000365563
107 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
Y_RNA.369-201
ENST00000365568
117 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNU6V-201
ENST00000384105
107 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNU6-127P-201
ENST00000390897
107 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
U3.27-201
ENST00000391237
200 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNU6-758P-201
ENST00000516292
89 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MIR4473-201
ENST00000583731
91 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MIR4677-201
ENST00000584153
80 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MIR4768-201
ENST00000585270
74 nt
BASIC
0.23
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNA5SP368-201
ENST00000364298
116 nt
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MIR371B-201
ENST00000638082
66 nt
BASIC
0.22
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNU6-294P-201
ENST00000364999
102 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
MIR216B-201
ENST00000390186
82 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
snoU13.17-201
ENST00000458802
104 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
SNORA25.13-201
ENST00000516395
103 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
MIR3925-201
ENST00000584674
77 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
MIR548BB-201
ENST00000626714
66 nt
BASIC
0.21
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
SNORD114-15-201
ENST00000364687
72 nt
BASIC
0.2
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
Y_RNA.437-201
ENST00000384113
113 nt
BASIC
0.2
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
U7.6-201
ENST00000610841
64 nt
BASIC
0.2
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
Y_RNA.73-201
ENST00000362910
113 nt
BASIC
0.19
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
MIR548H2-201
ENST00000408874
88 nt
BASIC
0.19
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
SNORD42B-201
ENST00000458893
67 nt
BASIC
0.19
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
snoMBII-202.2-201
ENST00000517263
86 nt
BASIC
0.19
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
IGLVI-20-201
ENST00000519296
130 nt
BASIC
0.19
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
RNA5SP331-201
ENST00000364986
107 nt
BASIC
0.18
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
AC093729.1-201
ENST00000513074
128 nt
BASIC
0.18
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
RNA5SP67-201
ENST00000516422
131 nt
BASIC
0.18
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
MIR4315-1-201
ENST00000636800
73 nt
BASIC
0.18
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
MIR4315-2-201
ENST00000640925
73 nt
BASIC
0.18
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
RNU6-161P-201
ENST00000363051
106 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
SNORD114-31-201
ENST00000363219
75 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
Y_RNA.407-201
ENST00000383986
113 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
MIR643-201
ENST00000385267
97 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
TRAJ30-201
ENST00000390507
57 nt
APPRIS P1
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
RNU6-1177P-201
ENST00000391058
104 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
Y_RNA.611-201
ENST00000410682
108 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
RNU6-782P-201
ENST00000516852
104 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
AC140658.3-201
ENST00000567603
271 nt
BASIC
0.17
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
MIR516B1-201
ENST00000385211
90 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
RNU6ATAC17P-201
ENST00000516074
71 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
RNU6-762P-201
ENST00000517107
102 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
AC006160.2-201
ENST00000637708
154 nt
BASIC
0.16
□□□□□ -2.38
CAPN9
O14815
RNU6-495P-201
ENST00000362995
107 nt
BASIC
0.15
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
RNU6-1255P-201
ENST00000363434
112 nt
BASIC
0.15
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
SNORA42.1-201
ENST00000363515
137 nt
BASIC
0.15
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
RNU6-824P-201
ENST00000363724
104 nt
BASIC
0.15
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
MIR652-201
ENST00000385278
98 nt
BASIC
0.15
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
uc_338.10-201
ENST00000621872
182 nt
BASIC
0.15
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
RNU5F-1-201
ENST00000362507
117 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
RNU6-624P-201
ENST00000363411
107 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
SNORD115-37-201
ENST00000363768
82 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
RNU6-154P-201
ENST00000384306
106 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
MIR876-201
ENST00000401147
81 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
AC104408.1-201
ENST00000605241
170 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
KIF20B-201
ENST00000260753
6306 nt
APPRIS P3
TSL 1 (best)
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
MIR494-201
ENST00000349529
81 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
Y_RNA.43-201
ENST00000362670
111 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
RNY1P1-201
ENST00000364372
112 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
RNU6-979P-201
ENST00000383896
107 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
RNU7-188P-201
ENST00000517063
64 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
SCARNA11.2-201
ENST00000517183
154 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
MIR5588-201
ENST00000581890
63 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
IGLL4P-201
ENST00000614590
133 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
AC084368.1-201
ENST00000620935
65 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
RNA5SP214-201
ENST00000363378
118 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
SNORD114-9-201
ENST00000364370
72 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
MIR1295A-201
ENST00000408463
79 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
AL450471.1-201
ENST00000447509
127 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
AC097510.1-201
ENST00000510945
133 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
RN7SL660P-201
ENST00000614852
299 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
RNU6-382P-201
ENST00000365181
106 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
MIR582-201
ENST00000365731
98 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
MIR450A2-201
ENST00000385022
100 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
SNORD75.2-201
ENST00000408784
58 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
CAPN9
O14815
RNU7-24P-201
ENST00000458867
62 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
First
Previous
978
Next
Last
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms