Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNX13Q9Y5W8 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNX13Q9Y5W8 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNX13Q9Y5W8 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNX13Q9Y5W8 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNX13Q9Y5W8 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNX13Q9Y5W8 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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SNX13Q9Y5W8 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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SNX13Q9Y5W8 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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SNX13Q9Y5W8 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX13Q9Y5W8 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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SNX13Q9Y5W8 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX13Q9Y5W8 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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SNX13Q9Y5W8 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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SNX13Q9Y5W8 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNX13Q9Y5W8 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNX13Q9Y5W8 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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SNX13Q9Y5W8 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
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SNX13Q9Y5W8 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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SNX13Q9Y5W8 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNX13Q9Y5W8 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNX13Q9Y5W8 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNX13Q9Y5W8 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
SNX13Q9Y5W8 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
SNX13Q9Y5W8 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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