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Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6
OPN4, Melanopsin, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
OPN4
Q9UHM6
MIR451A-201
ENST00000385059
72 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
OPN4
Q9UHM6
MIR214-201
ENST00000385214
110 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
OPN4
Q9UHM6
MIR4536-1-201
ENST00000583537
88 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
OPN4
Q9UHM6
MIR548O2-201
ENST00000616090
70 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
OPN4
Q9UHM6
SNORD116-21-201
ENST00000384507
92 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNU6-813P-201
ENST00000384691
107 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNU6-412P-201
ENST00000516434
106 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
IGLVI-20-201
ENST00000519296
130 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
MIR5589-201
ENST00000579442
60 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
AC103810.7-201
ENST00000607821
91 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
MIRLET7F1-201
ENST00000362202
87 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP98-201
ENST00000363158
137 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1107P-201
ENST00000364817
104 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1014P-201
ENST00000383940
103 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.467-201
ENST00000384297
102 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNU6-959P-201
ENST00000384671
107 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.563-201
ENST00000384707
108 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
AC244250.2-201
ENST00000418731
148 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNU7-85P-201
ENST00000458851
63 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.677-201
ENST00000516401
85 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNU6-175P-201
ENST00000516896
107 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
MIR3666-201
ENST00000607845
111 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
MIR20A-201
ENST00000362279
71 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.437-201
ENST00000384113
113 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
MIR652-201
ENST00000385278
98 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNU6-644P-201
ENST00000391155
98 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
U3.27-201
ENST00000391237
200 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.601-201
ENST00000410500
113 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP476-201
ENST00000516613
103 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
MIR6507-201
ENST00000613630
70 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
DLEU2_3.1-201
ENST00000620005
73 nt
BASIC
-0.25
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNU6-811P-201
ENST00000384069
107 nt
BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
AC008267.6-201
ENST00000441664
139 nt
BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
AC079760.1-201
ENST00000456952
202 nt
TSL 3
BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNU6-795P-201
ENST00000516323
103 nt
BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
MIR4777-201
ENST00000583710
86 nt
BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
MIR548Z-201
ENST00000584743
97 nt
BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
LMBR1-222
ENST00000638959
93 nt
TSL 5
BASIC
-0.26
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.261-201
ENST00000364631
102 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNU6-54P-201
ENST00000365563
107 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1036P-201
ENST00000383959
104 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
MIR548U-201
ENST00000390728
81 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
AC244090.1-201
ENST00000441884
93 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
FGF7P7-201
ENST00000514120
227 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
AC012531.4-201
ENST00000616509
177 nt
BASIC
-0.27
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
SNORD114-31-201
ENST00000363219
75 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP205-201
ENST00000364653
136 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNU6-132P-201
ENST00000383863
107 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
IL6ST-207
ENST00000396816
168 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
MIR548M-201
ENST00000408260
86 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
SNORA19.1-201
ENST00000410656
129 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
TMSB4XP3-201
ENST00000445144
114 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
SCARNA17.3-201
ENST00000516381
125 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
RNU6-762P-201
ENST00000517107
102 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
MIR4263-201
ENST00000584745
83 nt
BASIC
-0.28
□□□□□ -2.45
OPN4
Q9UHM6
MIR655-201
ENST00000362159
97 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1144P-201
ENST00000384247
104 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP300-201
ENST00000391197
107 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
RNU6-519P-201
ENST00000410590
108 nt
BASIC
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□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1052P-201
ENST00000411398
104 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
SNORD4B-201
ENST00000459083
72 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
SCARNA23-201
ENST00000516060
130 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
RNU6-904P-201
ENST00000516206
101 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
RNU6-719P-201
ENST00000516671
104 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
MIR3064-201
ENST00000581130
66 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
AL365222.1-201
ENST00000614661
98 nt
BASIC
-0.29
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.185-201
ENST00000363894
100 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
SNORD114-4-201
ENST00000363962
75 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
RNU6-81P-201
ENST00000365608
104 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
RNU6-455P-201
ENST00000384681
107 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
RNU6-476P-201
ENST00000384726
107 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.705-201
ENST00000516862
110 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
AC104996.3-201
ENST00000590718
94 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
MIR4788-201
ENST00000639104
80 nt
BASIC
-0.3
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
RNU6-972P-201
ENST00000391208
107 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
MIR1302-5-201
ENST00000408164
150 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1064P-201
ENST00000410626
104 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
AP000676.1-201
ENST00000533307
52 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
MIR4645-201
ENST00000583158
77 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
SNORA63.2-201
ENST00000362603
126 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.96-201
ENST00000363092
109 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.491-201
ENST00000384417
107 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
RNU6-887P-201
ENST00000410660
100 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
MIR4493-201
ENST00000584016
73 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
AP001180.6-201
ENST00000584918
159 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
ST7-OT3_3.1-201
ENST00000611709
115 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
MIR6086-201
ENST00000638065
55 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
SNORD58A-201
ENST00000383875
65 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
AL031386.1-201
ENST00000411940
142 nt
TSL 5
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
SNORD42B-201
ENST00000458893
67 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
SNORD2-201
ENST00000459163
69 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
MIR3140-201
ENST00000583685
90 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
SYCP2-202
ENST00000371001
5479 nt
APPRIS P2
TSL 1 (best)
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
MIR582-201
ENST00000365731
98 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
MIR590-201
ENST00000385008
97 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
SNORA49-201
ENST00000386157
136 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
MIR548E-201
ENST00000408287
88 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
RNU6-62P-201
ENST00000516526
102 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
AL590491.3-201
ENST00000610731
82 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
OPN4
Q9UHM6
MIR6129-201
ENST00000616087
109 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
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