Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.47□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GDAP2Q9NXN4 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
GDAP2Q9NXN4 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 373.5 ms