Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
LHX9Q9NQ69 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.2 ms