Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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USP49Q70CQ1 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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USP49Q70CQ1 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
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USP49Q70CQ1 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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USP49Q70CQ1 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
USP49Q70CQ1 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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USP49Q70CQ1 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USP49Q70CQ1 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USP49Q70CQ1 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USP49Q70CQ1 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USP49Q70CQ1 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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USP49Q70CQ1 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
USP49Q70CQ1 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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USP49Q70CQ1 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
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USP49Q70CQ1 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
USP49Q70CQ1 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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