Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
TBR1Q16650 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
TBR1Q16650 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TBR1Q16650 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182 ms