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Protein–RNA interactions for Protein: Q16585
SGCB, Beta-sarcoglycan, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SGCB
Q16585
RNU6-479P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
RNU5B-6P-201
ENST00000516765
68 nt
BASIC
-0.11
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
CR383656.4-201
ENST00000546909
122 nt
BASIC
-0.11
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
MIR548Z-201
ENST00000584743
97 nt
BASIC
-0.11
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
AC012531.4-201
ENST00000616509
177 nt
BASIC
-0.11
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
Clostridiales-1.4-201
ENST00000636807
150 nt
BASIC
-0.11
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
SNORD113-1-201
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69 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
Y_RNA.407-201
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113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
U3.27-201
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200 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
SNORA19.1-201
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129 nt
BASIC
-0.12
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
SCARNA23-201
ENST00000516060
130 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
RNU6-795P-201
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103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
MIR548AE1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
MIR548O2-201
ENST00000616090
70 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
MIR6514-201
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70 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
MIR148A-201
ENST00000362215
68 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
AL603908.1-201
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201 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
MIR1302-5-201
ENST00000408164
150 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
AL031386.1-201
ENST00000411940
142 nt
TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
Y_RNA.677-201
ENST00000516401
85 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
RNU6-537P-201
ENST00000517277
103 nt
BASIC
-0.13
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
RN7SL660P-201
ENST00000614852
299 nt
BASIC
-0.13
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
Y_RNA.30-201
ENST00000362572
97 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
RNU6-1056P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
MIR451A-201
ENST00000385059
72 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
RNU6-1154P-201
ENST00000391001
104 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
RNU6-589P-201
ENST00000516485
107 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
RNU7-188P-201
ENST00000517063
64 nt
BASIC
-0.14
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
CCDC7-215
ENST00000639629
4158 nt
APPRIS ALT2
TSL 5
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
MIRLET7F1-201
ENST00000362202
87 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
SNORD114-29-201
ENST00000364819
70 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
RNU6-46P-201
ENST00000383860
107 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
RNU6V-201
ENST00000384105
107 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
RNU6-154P-201
ENST00000384306
106 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
RNU6-106P-201
ENST00000384405
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
RNU6-972P-201
ENST00000391208
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
SNORD4B-201
ENST00000459083
72 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
RNU6-313P-201
ENST00000516317
112 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
Y_RNA.705-201
ENST00000516862
110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SGCB
Q16585
MIR6129-201
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BASIC
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SGCB
Q16585
DLEU2_3.1-201
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BASIC
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SGCB
Q16585
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109 nt
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
MIR329-2-201
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84 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
RNU6-554P-201
ENST00000410466
106 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
RNU6-175P-201
ENST00000516896
107 nt
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SGCB
Q16585
SNORA18.1-201
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BASIC
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SGCB
Q16585
RNU6-302P-201
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107 nt
BASIC
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SGCB
Q16585
RNU6-132P-201
ENST00000383863
107 nt
BASIC
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SGCB
Q16585
SNORD58A-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
Y_RNA.437-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
RNU6-1113P-201
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BASIC
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SGCB
Q16585
MIR590-201
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BASIC
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SGCB
Q16585
MIR548U-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
RNU6-887P-201
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BASIC
-0.17
□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
hsa-mir-3130-1.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
MIR20A-201
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BASIC
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SGCB
Q16585
MIR652-201
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SGCB
Q16585
RNU6ATAC11P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
RNU6-519P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
RNU2-51P-201
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BASIC
-0.18
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SGCB
Q16585
MIR3064-201
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SGCB
Q16585
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BASIC
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SGCB
Q16585
SNORA19-201
ENST00000384737
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SGCB
Q16585
AC244090.1-201
ENST00000441884
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
Y_RNA.709-201
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BASIC
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SGCB
Q16585
AC104996.3-201
ENST00000590718
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
ST7-OT3_3.1-201
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BASIC
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SGCB
Q16585
Y_RNA.818-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
Y_RNA.93-201
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BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
Y_RNA.273-201
ENST00000364703
102 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
RNU6-811P-201
ENST00000384069
107 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
IL6ST-207
ENST00000396816
168 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
SNORD4A-201
ENST00000459174
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
MIR6507-201
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70 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
SNORA63.2-201
ENST00000362603
126 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
RNA5SP98-201
ENST00000363158
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BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
Y_RNA.107-201
ENST00000363190
121 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
RNU6-54P-201
ENST00000365563
107 nt
BASIC
-0.21
□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
FGF7P7-201
ENST00000514120
227 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
SCARNA17.3-201
ENST00000516381
125 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
RNU6-766P-201
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BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
SNORD116-10-201
ENST00000363791
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
SNORD49B-201
ENST00000365172
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
SNORD114-12-201
ENST00000365400
75 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
Y_RNA.491-201
ENST00000384417
107 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
RNU6-1052P-201
ENST00000411398
104 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
RNU6-109P-201
ENST00000516364
107 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
Y_RNA.681-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
RNU6-184P-201
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107 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
RNU6-719P-201
ENST00000516671
104 nt
BASIC
-0.22
□□□□□ -2.44
SGCB
Q16585
MIR655-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
SGCB
Q16585
SNORD114-4-201
ENST00000363962
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BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SGCB
Q16585
SNORA24B-201
ENST00000384176
131 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SGCB
Q16585
AC244250.2-201
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148 nt
BASIC
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□□□□□ -2.45
SGCB
Q16585
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ENST00000427435
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BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SGCB
Q16585
RNU7-61P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.45
SGCB
Q16585
RNU6-789P-201
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102 nt
BASIC
-0.23
□□□□□ -2.45
SGCB
Q16585
Y_RNA.374-201
ENST00000365606
101 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
SGCB
Q16585
Y_RNA.544-201
ENST00000384650
113 nt
BASIC
-0.24
□□□□□ -2.45
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