Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SEMA3AQ14563 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SEMA3AQ14563 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SEMA3AQ14563 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEMA3AQ14563 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEMA3AQ14563 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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