Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPROQ16827 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPROQ16827 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPROQ16827 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPROQ16827 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPROQ16827 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPROQ16827 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPROQ16827 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.2 ms