Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTF1Q15361 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TTF1Q15361 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TTF1Q15361 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 282.8 ms