Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
LAPTM4AQ15012 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LAPTM4AQ15012 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LAPTM4AQ15012 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.2 ms