Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
RAPGEF1Q13905 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RAPGEF1Q13905 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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