Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CKAP4Q07065 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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