Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXQ1Q9C009 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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