Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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ZNF239Q16600 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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ZNF239Q16600 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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ZNF239Q16600 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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ZNF239Q16600 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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ZNF239Q16600 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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ZNF239Q16600 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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ZNF239Q16600 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
ZNF239Q16600 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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