Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
DDB1Q16531 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDB1Q16531 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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DDB1Q16531 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDB1Q16531 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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