Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
DSC3Q14574 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
DSC3Q14574 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
DSC3Q14574 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 557.7 ms