Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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CKAP4Q07065 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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CKAP4Q07065 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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CKAP4Q07065 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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CKAP4Q07065 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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CKAP4Q07065 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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CKAP4Q07065 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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CKAP4Q07065 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CKAP4Q07065 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CKAP4Q07065 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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