Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTPREP23469 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPREP23469 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPREP23469 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPREP23469 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPREP23469 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPREP23469 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPREP23469 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPREP23469 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPREP23469 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPREP23469 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPREP23469 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PTPREP23469 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPREP23469 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPREP23469 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPREP23469 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPREP23469 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPREP23469 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPREP23469 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPREP23469 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPREP23469 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPREP23469 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPREP23469 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPREP23469 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPREP23469 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPREP23469 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPREP23469 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPREP23469 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPREP23469 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPREP23469 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPREP23469 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPREP23469 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPREP23469 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPREP23469 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPREP23469 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPREP23469 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPREP23469 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPREP23469 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPREP23469 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPREP23469 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPREP23469 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPREP23469 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPREP23469 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPREP23469 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPREP23469 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPREP23469 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPREP23469 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPREP23469 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPREP23469 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPREP23469 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPREP23469 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPREP23469 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPREP23469 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPREP23469 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPREP23469 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPREP23469 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPREP23469 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPREP23469 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPREP23469 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPREP23469 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPREP23469 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
PTPREP23469 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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PTPREP23469 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPREP23469 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPREP23469 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPREP23469 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPREP23469 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPREP23469 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPREP23469 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPREP23469 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPREP23469 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPREP23469 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPREP23469 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPREP23469 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPREP23469 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPREP23469 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPREP23469 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPREP23469 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPREP23469 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTPREP23469 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPREP23469 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPREP23469 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPREP23469 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPREP23469 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPREP23469 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPREP23469 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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