Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
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USP49Q70CQ1 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USP49Q70CQ1 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USP49Q70CQ1 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP49Q70CQ1 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP49Q70CQ1 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP49Q70CQ1 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP49Q70CQ1 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP49Q70CQ1 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP49Q70CQ1 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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USP49Q70CQ1 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
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USP49Q70CQ1 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP49Q70CQ1 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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USP49Q70CQ1 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
USP49Q70CQ1 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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USP49Q70CQ1 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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USP49Q70CQ1 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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USP49Q70CQ1 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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USP49Q70CQ1 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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