Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
ZNF239Q16600 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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