Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TNFAIP1Q13829 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265.4 ms