Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SQSTM1Q13501 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SQSTM1Q13501 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SQSTM1Q13501 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 348.6 ms