Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TMED1Q13445 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TMED1Q13445 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TMED1Q13445 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TMED1Q13445 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TMED1Q13445 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TMED1Q13445 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TMED1Q13445 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TMED1Q13445 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
TMED1Q13445 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-1.84□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
TMED1Q13445 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.86□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-1.87□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.88□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
TMED1Q13445 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
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