Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE3BQ13370 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PDE3BQ13370 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
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