Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NR1H3Q13133 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
NR1H3Q13133 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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NR1H3Q13133 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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NR1H3Q13133 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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NR1H3Q13133 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NR1H3Q13133 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NR1H3Q13133 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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