Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RABGGTBP53611 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RABGGTBP53611 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RABGGTBP53611 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
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