Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CLDN9O95484 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CLDN9O95484 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.6 ms