Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TMEM260Q9NX78 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TMEM260Q9NX78 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.4 ms