Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP49Q70CQ1 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
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USP49Q70CQ1 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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USP49Q70CQ1 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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USP49Q70CQ1 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
USP49Q70CQ1 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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USP49Q70CQ1 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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USP49Q70CQ1 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USP49Q70CQ1 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USP49Q70CQ1 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USP49Q70CQ1 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USP49Q70CQ1 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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USP49Q70CQ1 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USP49Q70CQ1 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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