Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
TBR1Q16650 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.18
TBR1Q16650 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TBR1Q16650 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 307.1 ms