Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ZNF239Q16600 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZNF239Q16600 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZNF239Q16600 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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