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Protein–RNA interactions for Protein: Q15532
SS18, Protein SSXT, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
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Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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BASIC
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□□□□□ -2.43
SS18
Q15532
MIR892B-201
ENST00000401279
77 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SS18
Q15532
AL603914.1-201
ENST00000401964
204 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SS18
Q15532
SNORD63B-201
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70 nt
BASIC
-0.15
□□□□□ -2.43
SS18
Q15532
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142 nt
BASIC
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□□□□□ -2.43
SS18
Q15532
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□□□□□ -2.43
SS18
Q15532
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□□□□□ -2.43
SS18
Q15532
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SS18
Q15532
MIR4500-201
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SS18
Q15532
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□□□□□ -2.43
SS18
Q15532
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□□□□□ -2.43
SS18
Q15532
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□□□□□ -2.43
SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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□□□□□ -2.43
SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.298-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
Y_RNA.521-201
ENST00000384560
114 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU4-70P-201
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139 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
MIR34C-201
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU4-69P-201
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BASIC
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SS18
Q15532
AC244250.2-201
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU7-48P-201
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BASIC
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SS18
Q15532
RNU7-159P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU6-758P-201
ENST00000516292
89 nt
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
EBAG9-207
ENST00000531677
777 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-0.16
□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
MIR5706-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
MIR548AE1-201
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
AC087741.2-201
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SS18
Q15532
MIR6514-201
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SS18
Q15532
MIR1295B-201
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SS18
Q15532
RNU6-524P-201
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
MIR635-201
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
MIR519A1-201
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
MIR548L-201
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SS18
Q15532
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Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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TSL 3
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SS18
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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SS18
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
Y_RNA.515-201
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SS18
Q15532
MIR516A2-201
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BASIC
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SS18
Q15532
MIR516A1-201
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SS18
Q15532
Z95118.1-201
ENST00000421372
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BASIC
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
AL161932.1-201
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SS18
Q15532
Y_RNA.809-201
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BASIC
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU6-175P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
MTND5P40-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
RNU6-1260P-201
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BASIC
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
Y_RNA.288-201
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BASIC
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SS18
Q15532
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82 nt
BASIC
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SS18
Q15532
RNU6-30P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
MIR604-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
MIR516B1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
snoU13.19-201
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BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
RNU6-850P-201
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BASIC
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Q15532
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120 nt
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BASIC
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SS18
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.44
SS18
Q15532
U8.6-201
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135 nt
BASIC
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117 nt
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Q15532
SNORD114-12-201
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75 nt
BASIC
-0.2
□□□□□ -2.44
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