Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CBX3Q13185 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
CBX3Q13185 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CBX3Q13185 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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