Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TRAF1Q13077 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TRAF1Q13077 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.9 ms