Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CLDN9O95484 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CLDN9O95484 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CLDN9O95484 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CLDN9O95484 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CLDN9O95484 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CLDN9O95484 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CLDN9O95484 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CLDN9O95484 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CLDN9O95484 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.1 ms