Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
FOXQ1Q9C009 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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FOXQ1Q9C009 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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FOXQ1Q9C009 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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FOXQ1Q9C009 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
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FOXQ1Q9C009 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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FOXQ1Q9C009 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
FOXQ1Q9C009 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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