Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC74AQ96AQ1 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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CCDC74AQ96AQ1 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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CCDC74AQ96AQ1 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC74AQ96AQ1 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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