Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDB1Q16531 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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DDB1Q16531 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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DDB1Q16531 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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DDB1Q16531 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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DDB1Q16531 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DDB1Q16531 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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