Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
VPS72Q15906 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VPS72Q15906 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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VPS72Q15906 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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VPS72Q15906 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
VPS72Q15906 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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