Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.65□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-2.66□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.83
SHPRHQ149N8 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-2.68□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-2.72□□□□□ -2.84
SHPRHQ149N8 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
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