Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL9A2Q14055 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL9A2Q14055 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
COL9A2Q14055 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
COL9A2Q14055 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
COL9A2Q14055 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A2Q14055 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A2Q14055 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A2Q14055 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A2Q14055 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A2Q14055 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A2Q14055 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A2Q14055 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A2Q14055 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
COL9A2Q14055 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
COL9A2Q14055 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
COL9A2Q14055 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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