Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CHRNEQ04844 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CHRNEQ04844 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CHRNEQ04844 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.8 ms