Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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RABGEF1Q9UJ41 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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RABGEF1Q9UJ41 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RABGEF1Q9UJ41 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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RABGEF1Q9UJ41 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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RABGEF1Q9UJ41 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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RABGEF1Q9UJ41 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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RABGEF1Q9UJ41 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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RABGEF1Q9UJ41 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RABGEF1Q9UJ41 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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