Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Q6P435 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Q6P435 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Q6P435 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
Q6P435 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
Q6P435 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Q6P435 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Q6P435 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
Q6P435 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
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