Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CHD4Q14839 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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CHD4Q14839 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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CHD4Q14839 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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CHD4Q14839 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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CHD4Q14839 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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CHD4Q14839 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
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CHD4Q14839 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
CHD4Q14839 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
CHD4Q14839 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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