Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
SSPNQ14714 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SSPNQ14714 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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